欢迎您访问上海体育学院运动科学学院!

师资队伍

首页 > 师资队伍 > 正文

徐炳祥

发布者:  时间:2021-09-17 19:17:41  浏览:

徐炳祥:博士,副教授,硕士生导师。

电子邮箱:xubingxiang@sus.edu.cn

所在院系,专业:运动科学学院,公共卫生与预防医学

研究方向:运动相关大数据整合与挖掘、运动引起的表观遗传学调控、生物信息学、基因表达调控网络。

个人简介

徐炳祥,男,2020年于中国科学院北京基因组研究所取得理学博士学位。拥有数学、统计学、计算机科学、生命科学、运动人体科学等多学科交叉背景。曾任职于中国科学院北京基因组研究所,江苏先声医学诊断有限公司等国内知名研究机构和企业。2021年3月进入上海体育学院任专任教师。

教育经历

· 2007/09-2011/06:东北师范大学,数学与统计学院,数学与应用数学/计算机软件,双学士

· 2011/09-2014/06:中南大学,数学与统计学院,概率论与数理统计,硕士

· 2016/09-2020/07:中国科学院大学,中国科学院北京基因组研究所,生物信息学,博士

开设课程

· 医学统计学(本科/研究生)、统计软件选讲。

社会任职

· 中国生物物理学会运动与公共健康分会青年理事

主要学术成果

Xu B*,#, Li X, GaoX, Jia Y, Liu J, Li F, Zhang Z. DeNOPA: decoding nucleosome positionssensitively with sparse ATAC-seq data. Briefings in Bioinformatics. 2022Jan;23(1):bbab469.

Xu B*, Lu M, YanL, Ge M, Ren Y, Wang R, Shu Y, Hou L, Guo H. A Pan-Cancer Analysis ofPredictive Methylation Signatures of Response to Cancer Immunotherapy.Frontiers in immunology. 2021;12.

Xu B, Chen J, Zhang S, Shen S, Lan X, Chen Z, Yan Z,Xu B#. AssociationBetween the Severity of Diabetic Retinopathy and Optical Coherence TomographyAngiography Metrics. Frontiers in endocrinology. 2021;12.

Li F, Wang D, Song R, Cao C, Zhang Z, Wang Y, Li X, Huang J, LiuQ, Hou N,Xu B. The asynchronousestablishment of chromatin 3D architecture between in vitro fertilized anduniparental preimplantation pig embryos. Genome biology. 2020 Dec;21(1):1-21.

Li A, Yin X,Xu B, Wang D, Han J, Wei Y, Deng Y, Xiong Y, Zhang Z. Decodingtopologically associating domains with ultra-low resolution Hi-C data by graphstructural entropy. Nature communications. 2018 Aug 15;9(1):1-2.

Zhang H, Li F, Jia Y,XuB, Zhang Y, Li X, Zhang Z. Characteristic arrangement ofnucleosomes is predictive of chromatin interactions at kilobase resolution.Nucleic acids research. 2017 Dec 15;45(22):12739-51.

Xu B*, Ge H, ZhangZ. An efficient and assumption-free method to approximate protein leveldistribution in the two-states gene expression model. Journal of TheoreticalBiology. 2017 Nov 21;433:1-7.

Xu B*, Zhang Z.Computational inference of physical spatial organization of eukaryotic genomes.Quantitative Biology. 2016 Dec;4(4):302-9.

参与科研项目

· 基于ATAC-seq高精度预测染色质相互作用的新方法和基于增强现实的3D基因组数据可视化,国家自然科学基金,2019.1-2022.12

    Copyright © 上海体育学院 运动科学学院            上海市杨浦区恒仁188号 邮编:200438 电话:(86-21)65507356